半滑舌鳎全基因组测序完成

中国水产门户网报道      中国水产科学研究院黄海水产研究所和深圳华大基因研究院日前共同对外宣布，其联合启动的半滑舌鳎全基因组测序和基因图谱绘制研究项目已圆满完成。 

　　这是我国完成的第一个鱼类基因组测序项目和全基因组序列图谱，使半滑舌鳎成为世界上第一个测定了全基因组序列的鲽形目鱼类。该项目得到了科技部、农业部和国家自然科学基金委员会等部门的支持。

　　半滑舌鳎俗名鳎米鱼，是我国特有的名贵经济海水鱼类。由于其味道鲜美、肉质细嫩、营养丰富，市场价值极高，我国沿海地区普遍养殖，年产值达15至20亿元人民币。此外，半滑舌鳎性别决定类型为ＺＷ型，雌性具有异型性染色体，雌、雄生长差异巨大，雌性个体比雄性个体生长快2到4倍，是目前发现的雌雄生长差异最大的鱼类之一。由于雄性个体生长缓慢，影响了半滑舌鳎养殖产业的发展。因此，测定半滑舌鳎全基因组序列，寻找半滑舌鳎性别特异或决定基因，探索性别控制的生物技术途径，不仅对于鱼类性别决定机制的基础研究具有重要的科学意义，而且对于半滑舌鳎养殖产业的发展具有重要的应用价值和推广前景。

　　近几年来，黄海水产研究所采用分子标记技术相继筛选到半滑舌鳎雌性特异分子标记，建立了遗传性别鉴定的ＰＣＲ技术和分子标记辅助性别控制技术。为筛选半滑舌鳎性别特异或性别决定基因，阐明半滑舌鳎性别决定和控制的分子机理，该所陈松林研究员和深圳华大基因研究院王俊博士于2009年12月联合启动了半滑舌鳎全基因组测序和基因图谱绘制研究项目，依托深圳华大基因研究院自主研发的一系列序列拼接组装和分析软件，最近成功进行了半滑舌鳎鱼全基因组测序，绘制了半滑舌鳎基因组图谱，为半滑舌鳎性别控制和基因组选择育种等奠定重要基础。

　　据悉，半滑舌鳎基因组是深圳华大基因研究院“千种动植物基因组计划”的启动项目之一。到目前为止，华大基因和合作者们已经启动了100多种重要动植物的基因组测序分析项目，这些物种涉及的领域涵盖模式生物、海洋生物、农作物、家禽家畜、昆虫、稀有物种、园艺和生物能源物种等。