中国水产门户网报道目前应用的光合细菌大多是属于红螺菌科的红假单胞菌属，常用的有3～5种。不同菌种的特点和效用是有差异的。如沼泽红假单胞菌净化水质的效果比较理想；球形红假单胞菌细胞个体较大，生长迅速，生物量较高，适用于做饲料添加剂；而荚膜红假单胞菌防病治病的作用较强。用户应根据自己的需要选择不同的菌种。
若需多方面应用时，宜选用沼泽红假单胞菌为主，辅以荚膜红假单胞菌和球形红假单胞菌的混合菌种。
采集:黄子
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