由浙江海洋学院院长吴常文教授领衔,浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等机构联合破译了大黄鱼全基因组测序,构建了大黄鱼基因组图谱,成功解析了其先天免疫系统基因组特征。这是继半滑舌鳎之后,我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱,也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱,揭开了我国大黄鱼基因组学研究的序幕。我国大黄鱼研究从此进入组学时代。
大黄鱼人工养殖1985年取得成功,进而成为我国网箱养殖产量最高的海水经济鱼类。但随着养殖产业的进一步发展,人工养殖大黄鱼遗传多样性降低、抗病能力减弱。
“养殖大黄鱼抗病能力差,是不是可能与其免疫系统的特定基因组及其特定进化模式有关联?”团队成员通过大黄鱼基因组测序、基因注释,解析大黄鱼抗病性状的遗传基础。吴常文教授领衔的科研团队研究发现,大黄鱼基因组预估大小为728Mb,具有19,362个蛋白质编码基因。系统发育树表明,大黄鱼在基因组成、基因结构、序列同源性等方面与三刺鱼最为接近。
吴常文教授领衔的科研团队对大黄鱼进行了高深度全基因测序、从头组装和分析,发现大黄鱼具有发育良好的先天免疫系统,形成了一套独特的免疫模式,部分基因在大黄鱼先天性免疫方面起重要作用。
除免疫性状外,通过基因组信息的挖掘,还可以发现更多与大黄鱼生长、抗逆、性成熟等生产性状有关的基因,新的研究可望大大提高养殖大黄鱼生产性能,促进今后大黄鱼增养殖产业的发展。“希望通过我们的努力,更多的野生大黄鱼能走进普通老百姓的餐桌。”吴常文对未来充满期待。
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